Родился в 1966 г. в семье московского художника Виктора Пивоварова и писательницы Ирины Пивоваровой. В 1985–1987 гг. учился в Академии Изящных искусств в Праге. В 1987 г. основал группу «Инспекция Медицинская герменевтика» вместе с художниками Сергеем Ануфриевым и Юрием Лейдерманом. Группа просуществовала до 2001 г.
В работах Пепперштейна взору зрителя открываются загадочные гибридные миры, соединяющие мотивы русской и античной мифологии, авангардные формы в стиле Эля Лисицкого и Казимира Малевича и антураж голливудской фантастики. Этот коллаж культур автор часто сопровождает собственным рукописным комментарием, добавляя работам игровой элемент.
Павел Пепперштейн — создатель и идеолог течения «психоделический реализм». В его работах смешиваются узнаваемые культурные образы и остроумные комментарии, произведения наполнены отсылками к сюрреализму, супрематистским моделям Малевича, восточным акварелям, поп-арту, книжным иллюстрациям и политической карикатуре. За всё время художественной деятельности у Пепперштейна состоялось более 100 персональных и групповых выставок в России и за рубежом. В 2009 г. принял участие в основном проекте и выставке в павильоне России 53-й Венецианской биеннале. В том же году стал финалистом премии Кандинского за проект «Город Россия». В 2014-м — лауреат премии Кандинского в номинации «Проект года». В 2014 г. принял участие в биеннале «Манифеста 10» (Санкт-Петербург), в 2017 г. — в 1-й Триеннале российского современного искусства (Музей современного искусства «Гараж»). Работы художника находятся в собраниях Русского музея, Третьяковской галереи, Центра Помпиду, Kunsthalle Dusseldorf и др. Живет и работает в Москве.
